2013시즌은 수원 FC가 프로 진출 이후 치르는 첫 시즌이다. 광주 FC에서 뛰었던 보그단 밀리치와 태국에서 활약하던 알렉산다르 요바노비치를 영입하였다. 첫 경기인 부천과의 개막전에서 역전패를 당하는 등, 3경기 연속 무승행진을 달렸으나 광주 FC와의 원정 경기에서 프로 통산 첫 승을 거뒀다. 이후 FA컵에서 K리그 클래식의 대구 FC를 김한원의 PK골로 침몰시켰으나, 리그에서는 홈 첫승을 리그 개막 3개월만인 6월 6일에 거두었다. 이후 9월 28일 광주와의 원정경기에서 패배하기 전까지 8경기 연속 원정 무패를 이어가면서 '원정깡패'라는 별명을 얻기도 했다.[1] 이후 FA컵에서는 대구에 이어 전남 드래곤즈를 꺾는 파란을 펼치며 8강까지 진출하는 위업을 달성했다. 8강전에서 K리그 클래식에서도 최강으로 불리는 전북 현대 모터스를 만났고, 전북은 이래적으로 하위리크팀과의 경기에서 베스트11을 내보내었다. 결국 8강에서 전북에 7:2로 패배하였다. 그러나 K리그 클래식 최강팀인 전북을 상대로 2골을 얻은 것은 고무적이었다. 2013년 K리그 챌린지 최종 순위는 4위로, 상주 상무나 경찰 축구단, 그리고 클래식에서 강등된 광주를 제외한 팀들 가운데서는 가장 높은 순위를 차지했다.
2012년 12월 9일 프로 전환이 확정되어 K리그에 참가하게 되었고, 공식 명칭도 수원 FC로 확정하고 본격적인 프로리그 시즌을 준비했다.
| 라운드
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날짜
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홈팀
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원정팀
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경기결과
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| 1
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2013/3/16
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수원
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부천
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2:3 (패)
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| 2
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2013/3/23
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상주
|
수원
|
1:1 (무)
|
| 3
|
2013/3/30
|
고양
|
수원
|
1:1 (무)
|
| 4
|
2013/4/7
|
광주
|
수원
|
3:4 (승)
|
| 5
|
2013/4/21
|
수원
|
충주
|
1:2 (패)
|
| 6
|
2013/4/28
|
안양
|
수원
|
2:2 (무)
|
| 7
|
2013/5/5
|
수원
|
경찰
|
1:2 (패)
|
| 8
|
2013/5/11
|
수원
|
고양
|
0:0 (무)
|
| 9
|
2013/5/20
|
수원
|
상주
|
1:2 (패)
|
| 10
|
2013/5/26
|
부천
|
수원
|
3:3 (무)
|
| 11
|
2013/6/1
|
수원
|
광주
|
1:2 (패)
|
| 12
|
2013/6/6
|
수원
|
경찰
|
3:0 (승)
|
| 13
|
2013/6/9
|
충주
|
수원
|
0:1 (승)
|
| 14
|
2013/6/16
|
수원
|
안양
|
2:3 (패)
|
| 15
|
2013/7/1
|
고양
|
수원
|
1:2 (승)
|
| 16
|
2013/7/6
|
수원
|
경찰
|
2:3 (패)
|
| 17
|
2013/7/14
|
수원
|
충주
|
3:0 (승)
|
| 18
|
2013/8/3
|
안양
|
수원
|
2:2 (무)
|
| 19
|
2013/8/11
|
수원
|
부천
|
3:3 (무)
|
| 20
|
2013/8/18
|
상주
|
수원
|
0:0 (무)
|
| 21
|
2013/8/26
|
수원
|
광주
|
3:1 (승)
|
| 22
|
2013/8/31
|
수원
|
고양
|
1:2 (패)
|
| 23
|
2013/9/7
|
부천
|
수원
|
0:1 (승)
|
| 24
|
2013/9/15
|
충주
|
수원
|
0:1 (승)
|
| 25
|
2013/9/22
|
수원
|
경찰
|
0:1 (패)
|
| 26
|
2013/9/28
|
광주
|
수원
|
2:1 (패)
|
| 27
|
2013/10/5
|
수원
|
상주
|
0:1 (패)
|
| 28
|
2013/10/12
|
수원
|
안양
|
1:0 (승)
|
| 29
|
2013/10/19
|
고양
|
수원
|
2:0 (패)
|
| 30
|
2013/10/26
|
수원
|
광주
|
2:1 (승)
|
| 31
|
2013/11/3
|
수원
|
경찰
|
2:0 (승)
|
| 32
|
2013/11/9
|
안양
|
수원
|
0:1 (승)
|
| 33
|
2013/11/16
|
충주
|
수원
|
2:1 (패)
|
| 34
|
2013/11/24
|
수원
|
부천
|
2:1 (승)
|
| 35
|
2013/11/30
|
상주
|
수원
|
4:1 (패)
|
(1) 우선지명 : 각 구단 유소년 클럽 출신 선수들에 대해 4명까지 우선 지명
(2) 일반지명 : 1순위에서 6순위까지 추첨순서에서 의해서 지명하며 유소년클럽 출신에 대한
000우선지명이 3순위 지명권에 해당되며 구단 사정에 따라 지명권을 행사 안 할 수 있음
(3) 번외지명 : 6순위까지 끝나고 번외로 다시 6순위까지 선수 지명
(4) 추가지명 : 드래프트에서 미선발된 선수들에 한하여 2월말까지 구단 자율적으로 지명
- (대) 표기는 드래프트에 참여하여 선발은 되었지만 당해 연도에 입단하지 않고 대학 진학 후 입단하는 선수를 의미한다.
- (대후) 표기는 드래프트에 기 선발된 후 대학에 진학하여 중퇴 및 졸업 후 당해 연도에 입단하는 선수를 의미한다.
조덕제
보그단
알렉스