FASTA 포맷
FASTA 포맷은 염기서열 혹은 단백질서열을 문자열로 표현한 것이다. 이 포맷은 FASTA 소프트웨어 패키지가 기원이지만 현재는 생물정보학 분야에서 표준에 가깝게 사용되고 있다.[4]
| 파일 확장자 | .fasta, .fna, .ffn, .faa, .frn, .fa |
|---|---|
| 인터넷 미디어 타입 | text/x-fasta |
| UTI | 아니오 |
| 개발 | David J. Lipman William R. Pearson[1][2] |
| 발표일 | 1985 |
| 포맷 종류 | 생물정보학 |
| 다음으로부터 확장 | ASCII (FASTA용) |
| 다음으로 확장 | FASTQ 포맷[3] |
| 웹사이트 | www |
각주
편집- ↑ Lipman DJ, Pearson WR (March 1985). “Rapid and sensitive protein similarity searches”. 《Science》 227 (4693): 1435–41. Bibcode:1985Sci...227.1435L. doi:10.1126/science.2983426. PMID 2983426.
- ↑ Pearson WR, Lipman DJ (April 1988). “Improved tools for biological sequence comparison”. 《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》 85 (8): 2444–8. Bibcode:1988PNAS...85.2444P. doi:10.1073/pnas.85.8.2444. PMC 280013. PMID 3162770.
- ↑ Cock PJ, Fields CJ, Goto N, Heuer ML, Rice PM (April 2010). “The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants”. 《Nucleic Acids Research》 38 (6): 1767–71. doi:10.1093/nar/gkp1137. PMC 2847217. PMID 20015970.
- ↑ “What is FASTA Format?”. 《zhanglab.ccmb.med.umich.edu》. explains the FASTA format
외부 링크
편집- What is FASTA Format? - FASTA 포맷 설명 (영어)
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